法律分析：员工在扣除社保和住房公积金之后，剩余部分应该达到31275元，个人所得税就需要缴纳5000元。
法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》 第三条 个人所得税的税率：
（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；
（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；
（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。
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