租金专项附加扣除是按照定额扣除的方式来扣的。有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款；住房租金支出则由签订租赁住房合同的承租人定额扣除。
《个人所得税专项扣除暂行办法》
第十七条
纳税人在主要工作城市没有自有住房而发生的住房租金支出，可以按照以下标准定额扣除：
（一）直辖市、省会（首府）城市、计划单列市以及国务院确定的其他城市，扣除标准为每月1500元；
（二）除第一项所列城市以外，市辖区户籍人口超过100万的城市，扣除标准为每月1100元；
市辖区户籍人口不超过100万的城市，扣除标准为每月801元。
纳税人的配偶在纳税人的主要工作城市有自有住房的，视同纳税人在主要工作城市有自有住房。
市辖区户籍人口，以国家统计局公布的数据为准。
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